Que tal Andreuu,
Las unidades de frecuencia dependen de tu frecuencia de muestreo.
Si tu frecuencia de muestreo es 44100 tus datos validos van a ir de 0 a 22050Hz. Ahora, dependiendo de que VIs estés utilizando es posible que tengas los datos en espejo, es decir de -22050Hz a 22050Hz.Si este es el caso debes tomar nada mas la mitad de los datos. En la mayoría de los análisis de frecuencia tus resultados tienen la mitad de muestras de los datos originales.
Hay un documento muy completo en este link (en ingles):
http://zone.ni.com/devzone/conceptd.nsf/2d17d611efb58b22862567a9006ffe76/c045a890751303a6862568650061ea98?OpenDocument
Espero que te sea de utilidad esta información,
Juan Carlos