Olá Yves, bom dia.
Pelo que eu entendi de sua aplicação, é somente a pergunta relacionada às funções que o LabVIEW irá utilizar com o Microsoft Office, por exemplo, na geração de relatórios.
Os conflitos que você irá enfrentar será, provavelmente, quando utilizar alguma propriedade da versão anterior do Office que está diferente ou não mais existe na versão atualizada.
Se você for fazer a atualização do pacote Office, aconselho instalar no diretório default do CD. Se estiver usado funções do LabVIEW para geração de relatório, elas já associam diretamente ao Excel.
Caso lhe reste mais dúvidas, não hesite em manter contato.
Atenciosamente,
Filipe Martarello