Hola,
Tomando en cuenta lo que mencionas acerca de que copiaste de manera manual los VIs del Toolkit de Simulación y Control lo que está pasando es que estas funciones no están debidamente actualizadas en LabVIEW; tu aplicación debe tener dependencias a subVIs que no se pueden encontrar.
Mi recomendación entonces es realizar una compilación en masa (mass compile) de los directorios o librerías que contienen los VIs del Toolkit; posteriormente intentar de nuevo construir el ejecutable. Para realizar dicha tarea debes en LabVIEW debes ir a:
Tools » Advanced » Mass Compile
Puedes encontrar mas información sobre lo que hace la compilación en masa en el siguiente enlace:
http://digital.ni.com/public.nsf/websearch/654877E62A97B72986256C95006F9B24?OpenDocument
En caso de que el problema persista te invito a ponerte en contacto con Ingeniería de Aplicaciones de National Instruments; conoce nuestras opciones de soporte técnico en español:
http://www.ni.com/latam/soporte
Saludos,
Fernando Domínguez
Applications Engineer
National Instruments
Fernando D.
National Instruments