エラーの原因は、同じリソースを使うDAQアシスタントが複数あって、それらを同時に実行しようとしているためです（一つのタスクを停止せずに別のタスクを開始している）。
プログラムフローとして、「アナログ入力」→「表示・記録・判定」→「デジタル出力」を繰り返すようにすれば、DAQアシスタントはそれぞれ一か所だけで済みます。
3.1秒と3秒間の意味が分かりません。ポンプは停止後最低3秒間は再起動してはいけない、ということでしょうか？
+0.1MPaと-0.1MPaは圧力の絶対値ですか？それとも6MPa±0.1MPaという意味ですか？
ケース3のSTOPはプログラムを終了するという意味ですか？
