yuta1947さん、こんにちは
投稿いただいた内容だけでは少しアドバイスしづらく、他の方からも答えを得づらいかなと思います。
・「シーケンスストラクチャを利用して」とのことですが、シーケンスストラクチャを使用する必要があると思っていらっしゃるのはどういう理由でしょうか？（LabVIEWはシーケンスストラクチャを使用しなくてもワイヤ配線で実行順番を制御できますが、特別な理由がありますか？）
・「温度ごとに連続測定」で測定をする対象は温度でしょうか？あるいは温度ごとに何か別のものを測定するのでしょうか？
・HWは何を使用されているでしょうか？NI社の製品か、あるいは他社製の計測器かでプログラムの組み方も大きく変わるかなと思います。
プログラムの組み方
