La vostra osservazione è legittima e mi scuso per l'imprecisione.
Per prima cosa debbo comunicare che il problema si è risolto con l'installazione della versione NIDAQ 6.9.2.
La configurazione originale inizialmente utilizzata consiste in:
Pc con sistema operativo WINDOWS 2000 Professional, Data Acquisition Device: SCXI-1200, Software: LabView FDS for Windows 95/NT/3.1 Version 5.0.1. e NIDAQ 6.7.
LabView 5.0.1 apparentemente non ha dato problemi con WINDOWS 2000 (anche se segnala "Wrong OS" durante l'installazione) ed ho quindi installato una versione NIDAQ compresa tra la 6.6 e la 6.9.3 (la 6.7 appunto) come suggeritomi per supportare l'SCXI-1200.
La versione NIDAQ 6.7 installata genera invece il problema esposto e cioè ad ogni reboot del Pc, in MAX, la Porta Parellala destinata alla comunicazione con l'SCXI-1200 risulta "Not Assigned" mentre era stata regolarmente configurata come LPT1 ed aveva superato il Test Resources.
Nota: tutti gli accessi a Windows sono stati effettuati in qualità di Administrator.